保税区属境外，而增值税的征税范围是在中华人民共和国境内发生的销售货物和提供应税劳务。因此区内企业是不要交增值税。至于关税，区内企业一般情况下，也不用交。
如果货物从保税区最终进入了国内，进口关税和增值税一样需要交纳的，区别只是在于这个税由谁来交；如果是国内客户向保税区海关申报进口，那就是客户交；如果是贸易公司向保税区海关申报进口在国内转卖给客户，那就是贸易公司向海关交；
当然如果这个货物最终的客户是在国外的，没有进入国内，那么从保税区出口至国外就无需交纳进口关税和增值税。
保税区级别低于综合保税区。这是一国海关设置的或经海关批准注册、受海关监督和管理的可以较长时间存储商品的区域。是经国务院批准设立的、海关实施特殊监管的经济区域。保税区的功能定位为“保税仓储、出口加工、转口贸易”三大功能。
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