使用场景不同如下：
费用报销单一般用于直接费用的报销，差旅费、招待费，办公用品费等。
付款申请单一般用于采购付款，票到挂账，付款冲账。通常是外单位(通常指供应商)向公司要求支付货款时填写的单据，最终经领导批示同意后，会计做帐，出纳付款。借记预付帐款或者应付帐款，货记银行存款。
付款申请单是支付款项的申请和审批，是用于同意支付这笔款项的作用，主要目的是请领和支付款项。费用报销单是报销费用的审批，表示经济事项对应的款项可以进入费用或成本。
网友看法：第一点，付款申请单，是当产生了付款的义务时候需要填制的单据，比如货款退回需要重付款，工资退回需要重付款，或者是货物已到发票未到需要付款。
第二，费用报销单是实际费用已经发生，已经开具发票用来报销支付的单据。贵公司预付货款属于产生付款义务，需要付款单并经由经理签字，但是货物到时不属于费用报销，而是存货增加，所以不需要费用报销单。但是如果当月是办公费和电话费等费用，报销时属于费用增加，需要填制费用报销单。没必要填写付款申请单。
付款申请单在许多方面和和费用报销单都有定联系，以至于大家对两者分不清 ，本文大概讲了关于付款申请单和费用报销单有哪些区别的内容，请关注会计实务大全网。
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